Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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