Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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