Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
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