Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms