Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms