Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms