Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM29Q14134 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms