Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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COL4A6Q14031 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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COL4A6Q14031 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
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