Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms