Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
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