Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms