Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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