Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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