Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATMQ13315 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATMQ13315 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATMQ13315 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATMQ13315 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATMQ13315 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATMQ13315 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATMQ13315 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATMQ13315 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATMQ13315 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATMQ13315 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATMQ13315 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATMQ13315 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATMQ13315 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATMQ13315 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATMQ13315 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATMQ13315 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATMQ13315 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATMQ13315 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATMQ13315 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATMQ13315 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATMQ13315 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATMQ13315 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATMQ13315 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATMQ13315 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATMQ13315 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATMQ13315 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATMQ13315 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATMQ13315 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATMQ13315 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATMQ13315 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATMQ13315 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATMQ13315 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATMQ13315 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATMQ13315 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATMQ13315 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATMQ13315 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATMQ13315 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATMQ13315 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATMQ13315 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATMQ13315 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATMQ13315 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATMQ13315 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATMQ13315 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATMQ13315 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATMQ13315 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATMQ13315 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATMQ13315 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATMQ13315 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATMQ13315 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATMQ13315 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATMQ13315 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATMQ13315 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATMQ13315 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATMQ13315 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATMQ13315 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATMQ13315 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATMQ13315 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATMQ13315 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATMQ13315 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATMQ13315 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATMQ13315 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATMQ13315 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATMQ13315 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATMQ13315 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATMQ13315 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATMQ13315 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATMQ13315 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATMQ13315 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATMQ13315 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATMQ13315 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATMQ13315 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATMQ13315 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATMQ13315 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATMQ13315 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATMQ13315 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATMQ13315 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATMQ13315 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATMQ13315 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATMQ13315 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATMQ13315 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATMQ13315 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATMQ13315 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATMQ13315 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATMQ13315 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATMQ13315 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATMQ13315 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATMQ13315 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATMQ13315 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATMQ13315 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATMQ13315 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATMQ13315 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATMQ13315 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATMQ13315 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATMQ13315 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATMQ13315 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATMQ13315 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATMQ13315 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATMQ13315 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATMQ13315 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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