Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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