Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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