Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TROQ12816 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TROQ12816 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TROQ12816 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TROQ12816 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TROQ12816 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TROQ12816 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TROQ12816 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TROQ12816 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TROQ12816 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TROQ12816 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TROQ12816 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TROQ12816 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TROQ12816 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TROQ12816 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TROQ12816 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TROQ12816 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TROQ12816 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TROQ12816 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TROQ12816 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TROQ12816 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TROQ12816 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TROQ12816 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TROQ12816 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TROQ12816 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TROQ12816 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TROQ12816 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TROQ12816 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TROQ12816 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TROQ12816 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TROQ12816 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TROQ12816 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TROQ12816 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TROQ12816 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TROQ12816 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TROQ12816 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TROQ12816 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TROQ12816 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TROQ12816 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TROQ12816 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
TROQ12816 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
TROQ12816 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TROQ12816 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TROQ12816 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
TROQ12816 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TROQ12816 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TROQ12816 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TROQ12816 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TROQ12816 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TROQ12816 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TROQ12816 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TROQ12816 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TROQ12816 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TROQ12816 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TROQ12816 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TROQ12816 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TROQ12816 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TROQ12816 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TROQ12816 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TROQ12816 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TROQ12816 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TROQ12816 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TROQ12816 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TROQ12816 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TROQ12816 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TROQ12816 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TROQ12816 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TROQ12816 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TROQ12816 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TROQ12816 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TROQ12816 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TROQ12816 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TROQ12816 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TROQ12816 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TROQ12816 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TROQ12816 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TROQ12816 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TROQ12816 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TROQ12816 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TROQ12816 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TROQ12816 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
TROQ12816 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TROQ12816 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TROQ12816 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TROQ12816 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TROQ12816 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TROQ12816 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TROQ12816 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TROQ12816 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TROQ12816 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TROQ12816 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TROQ12816 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TROQ12816 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TROQ12816 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TROQ12816 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TROQ12816 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TROQ12816 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TROQ12816 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TROQ12816 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TROQ12816 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
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