Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms