Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLOD1Q02809 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms