Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms