Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMF1P82094 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMF1P82094 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMF1P82094 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TMF1P82094 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMF1P82094 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMF1P82094 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMF1P82094 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMF1P82094 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMF1P82094 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMF1P82094 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMF1P82094 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMF1P82094 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMF1P82094 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMF1P82094 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMF1P82094 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMF1P82094 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMF1P82094 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMF1P82094 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMF1P82094 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMF1P82094 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
TMF1P82094 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMF1P82094 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMF1P82094 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMF1P82094 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMF1P82094 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMF1P82094 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TMF1P82094 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TMF1P82094 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TMF1P82094 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TMF1P82094 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMF1P82094 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMF1P82094 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMF1P82094 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMF1P82094 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMF1P82094 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMF1P82094 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMF1P82094 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMF1P82094 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMF1P82094 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMF1P82094 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMF1P82094 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMF1P82094 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMF1P82094 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TMF1P82094 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMF1P82094 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMF1P82094 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMF1P82094 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMF1P82094 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMF1P82094 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMF1P82094 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMF1P82094 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMF1P82094 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMF1P82094 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMF1P82094 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMF1P82094 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMF1P82094 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMF1P82094 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMF1P82094 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMF1P82094 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMF1P82094 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMF1P82094 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMF1P82094 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMF1P82094 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMF1P82094 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMF1P82094 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMF1P82094 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMF1P82094 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMF1P82094 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMF1P82094 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMF1P82094 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMF1P82094 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMF1P82094 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMF1P82094 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMF1P82094 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMF1P82094 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMF1P82094 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMF1P82094 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMF1P82094 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMF1P82094 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMF1P82094 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMF1P82094 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMF1P82094 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMF1P82094 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMF1P82094 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMF1P82094 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMF1P82094 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMF1P82094 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMF1P82094 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMF1P82094 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMF1P82094 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMF1P82094 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TMF1P82094 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMF1P82094 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMF1P82094 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMF1P82094 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMF1P82094 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMF1P82094 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMF1P82094 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMF1P82094 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms