Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASIC1P78348 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms