Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms