Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX16P57768 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX16P57768 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX16P57768 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX16P57768 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX16P57768 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX16P57768 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX16P57768 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX16P57768 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX16P57768 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX16P57768 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX16P57768 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX16P57768 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX16P57768 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX16P57768 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX16P57768 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX16P57768 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX16P57768 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX16P57768 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX16P57768 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX16P57768 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX16P57768 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX16P57768 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX16P57768 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX16P57768 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX16P57768 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX16P57768 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX16P57768 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX16P57768 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX16P57768 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX16P57768 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX16P57768 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX16P57768 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX16P57768 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX16P57768 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX16P57768 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX16P57768 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX16P57768 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX16P57768 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX16P57768 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX16P57768 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX16P57768 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX16P57768 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX16P57768 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX16P57768 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX16P57768 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX16P57768 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX16P57768 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX16P57768 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX16P57768 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX16P57768 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX16P57768 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX16P57768 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX16P57768 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX16P57768 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX16P57768 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX16P57768 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX16P57768 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX16P57768 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX16P57768 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX16P57768 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX16P57768 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX16P57768 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX16P57768 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX16P57768 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX16P57768 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX16P57768 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX16P57768 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX16P57768 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX16P57768 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX16P57768 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX16P57768 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX16P57768 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX16P57768 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX16P57768 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX16P57768 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX16P57768 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX16P57768 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX16P57768 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX16P57768 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX16P57768 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX16P57768 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX16P57768 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX16P57768 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX16P57768 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX16P57768 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX16P57768 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX16P57768 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX16P57768 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX16P57768 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX16P57768 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX16P57768 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX16P57768 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX16P57768 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX16P57768 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX16P57768 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX16P57768 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX16P57768 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX16P57768 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX16P57768 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms