Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP1P56182 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP1P56182 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP1P56182 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP1P56182 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP1P56182 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP1P56182 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP1P56182 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP1P56182 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP1P56182 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP1P56182 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP1P56182 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP1P56182 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP1P56182 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP1P56182 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP1P56182 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP1P56182 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP1P56182 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1P56182 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1P56182 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1P56182 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1P56182 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1P56182 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1P56182 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1P56182 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1P56182 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1P56182 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1P56182 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1P56182 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1P56182 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1P56182 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1P56182 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1P56182 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1P56182 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1P56182 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1P56182 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1P56182 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1P56182 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1P56182 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1P56182 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1P56182 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1P56182 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1P56182 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1P56182 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1P56182 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1P56182 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1P56182 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1P56182 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1P56182 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1P56182 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1P56182 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1P56182 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1P56182 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1P56182 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1P56182 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1P56182 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1P56182 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1P56182 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1P56182 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1P56182 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1P56182 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1P56182 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1P56182 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1P56182 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1P56182 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1P56182 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1P56182 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1P56182 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1P56182 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1P56182 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1P56182 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1P56182 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1P56182 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1P56182 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1P56182 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1P56182 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1P56182 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1P56182 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1P56182 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1P56182 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1P56182 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1P56182 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1P56182 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1P56182 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1P56182 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1P56182 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1P56182 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1P56182 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRP1P56182 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRP1P56182 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRP1P56182 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRP1P56182 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRP1P56182 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRP1P56182 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRP1P56182 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1P56182 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1P56182 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1P56182 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1P56182 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1P56182 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms