Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACLYP53396 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACLYP53396 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACLYP53396 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACLYP53396 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACLYP53396 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACLYP53396 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ACLYP53396 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACLYP53396 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACLYP53396 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACLYP53396 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACLYP53396 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACLYP53396 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACLYP53396 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACLYP53396 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACLYP53396 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACLYP53396 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACLYP53396 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACLYP53396 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACLYP53396 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACLYP53396 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACLYP53396 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACLYP53396 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACLYP53396 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACLYP53396 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACLYP53396 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACLYP53396 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACLYP53396 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACLYP53396 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACLYP53396 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACLYP53396 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACLYP53396 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACLYP53396 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACLYP53396 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACLYP53396 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACLYP53396 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACLYP53396 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACLYP53396 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACLYP53396 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACLYP53396 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACLYP53396 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACLYP53396 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACLYP53396 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACLYP53396 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACLYP53396 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACLYP53396 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACLYP53396 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACLYP53396 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACLYP53396 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACLYP53396 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACLYP53396 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACLYP53396 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACLYP53396 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACLYP53396 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACLYP53396 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACLYP53396 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACLYP53396 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACLYP53396 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACLYP53396 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ACLYP53396 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACLYP53396 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACLYP53396 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACLYP53396 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACLYP53396 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACLYP53396 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACLYP53396 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACLYP53396 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACLYP53396 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACLYP53396 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACLYP53396 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACLYP53396 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACLYP53396 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACLYP53396 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACLYP53396 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACLYP53396 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACLYP53396 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACLYP53396 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACLYP53396 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACLYP53396 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACLYP53396 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACLYP53396 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACLYP53396 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACLYP53396 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACLYP53396 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACLYP53396 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACLYP53396 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACLYP53396 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACLYP53396 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACLYP53396 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACLYP53396 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACLYP53396 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACLYP53396 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACLYP53396 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACLYP53396 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACLYP53396 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACLYP53396 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACLYP53396 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACLYP53396 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACLYP53396 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACLYP53396 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms