Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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RAB5CP51148 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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RAB5CP51148 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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RAB5CP51148 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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RAB5CP51148 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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RAB5CP51148 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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RAB5CP51148 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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