Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCAMP50895 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCAMP50895 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCAMP50895 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCAMP50895 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCAMP50895 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCAMP50895 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCAMP50895 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCAMP50895 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCAMP50895 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCAMP50895 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCAMP50895 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCAMP50895 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCAMP50895 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAMP50895 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAMP50895 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAMP50895 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAMP50895 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAMP50895 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAMP50895 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAMP50895 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAMP50895 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAMP50895 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAMP50895 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAMP50895 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAMP50895 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAMP50895 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAMP50895 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAMP50895 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAMP50895 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAMP50895 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAMP50895 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAMP50895 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAMP50895 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
BCAMP50895 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAMP50895 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAMP50895 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAMP50895 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAMP50895 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAMP50895 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAMP50895 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAMP50895 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAMP50895 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAMP50895 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAMP50895 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAMP50895 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAMP50895 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAMP50895 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAMP50895 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAMP50895 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAMP50895 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAMP50895 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAMP50895 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAMP50895 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAMP50895 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAMP50895 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAMP50895 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAMP50895 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAMP50895 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAMP50895 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAMP50895 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAMP50895 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAMP50895 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAMP50895 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAMP50895 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms