Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCLCP48506 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCLCP48506 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCLCP48506 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCLCP48506 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GCLCP48506 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCLCP48506 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCLCP48506 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCLCP48506 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCLCP48506 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCLCP48506 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCLCP48506 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GCLCP48506 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCLCP48506 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCLCP48506 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCLCP48506 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCLCP48506 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
GCLCP48506 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GCLCP48506 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GCLCP48506 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GCLCP48506 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCLCP48506 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCLCP48506 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GCLCP48506 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCLCP48506 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCLCP48506 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCLCP48506 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCLCP48506 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLCP48506 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLCP48506 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLCP48506 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLCP48506 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLCP48506 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLCP48506 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLCP48506 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLCP48506 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLCP48506 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLCP48506 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLCP48506 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLCP48506 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLCP48506 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLCP48506 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLCP48506 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLCP48506 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLCP48506 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLCP48506 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLCP48506 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLCP48506 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLCP48506 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLCP48506 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLCP48506 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLCP48506 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLCP48506 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLCP48506 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLCP48506 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLCP48506 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLCP48506 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLCP48506 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLCP48506 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLCP48506 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLCP48506 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLCP48506 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLCP48506 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLCP48506 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLCP48506 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLCP48506 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLCP48506 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLCP48506 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLCP48506 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLCP48506 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLCP48506 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLCP48506 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLCP48506 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLCP48506 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLCP48506 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLCP48506 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLCP48506 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLCP48506 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLCP48506 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLCP48506 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLCP48506 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLCP48506 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLCP48506 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLCP48506 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLCP48506 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLCP48506 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLCP48506 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLCP48506 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLCP48506 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLCP48506 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLCP48506 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLCP48506 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLCP48506 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLCP48506 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLCP48506 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLCP48506 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLCP48506 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLCP48506 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLCP48506 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLCP48506 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms