Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSFMP43897 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSFMP43897 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSFMP43897 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSFMP43897 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSFMP43897 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSFMP43897 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSFMP43897 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSFMP43897 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSFMP43897 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSFMP43897 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSFMP43897 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSFMP43897 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSFMP43897 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSFMP43897 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSFMP43897 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSFMP43897 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSFMP43897 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSFMP43897 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSFMP43897 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSFMP43897 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSFMP43897 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSFMP43897 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSFMP43897 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSFMP43897 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSFMP43897 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSFMP43897 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSFMP43897 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSFMP43897 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSFMP43897 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSFMP43897 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSFMP43897 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSFMP43897 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSFMP43897 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSFMP43897 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TSFMP43897 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSFMP43897 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSFMP43897 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSFMP43897 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms