Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTGER2P43116 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGER2P43116 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms