Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PIK3CBP42338 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms