Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms