Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms