Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRMP28827 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
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