Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTX3P26022 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTX3P26022 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTX3P26022 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTX3P26022 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTX3P26022 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTX3P26022 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTX3P26022 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTX3P26022 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTX3P26022 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTX3P26022 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTX3P26022 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTX3P26022 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTX3P26022 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTX3P26022 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTX3P26022 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTX3P26022 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTX3P26022 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTX3P26022 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTX3P26022 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTX3P26022 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTX3P26022 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTX3P26022 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTX3P26022 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTX3P26022 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTX3P26022 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTX3P26022 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTX3P26022 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTX3P26022 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTX3P26022 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTX3P26022 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTX3P26022 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTX3P26022 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTX3P26022 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTX3P26022 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTX3P26022 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTX3P26022 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTX3P26022 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTX3P26022 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTX3P26022 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTX3P26022 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTX3P26022 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTX3P26022 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTX3P26022 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTX3P26022 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTX3P26022 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTX3P26022 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTX3P26022 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTX3P26022 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTX3P26022 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTX3P26022 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTX3P26022 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTX3P26022 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTX3P26022 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTX3P26022 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTX3P26022 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTX3P26022 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTX3P26022 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTX3P26022 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTX3P26022 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTX3P26022 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTX3P26022 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTX3P26022 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTX3P26022 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTX3P26022 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTX3P26022 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTX3P26022 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTX3P26022 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTX3P26022 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTX3P26022 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTX3P26022 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTX3P26022 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTX3P26022 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTX3P26022 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTX3P26022 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTX3P26022 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTX3P26022 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTX3P26022 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTX3P26022 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTX3P26022 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTX3P26022 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTX3P26022 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTX3P26022 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTX3P26022 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTX3P26022 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTX3P26022 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTX3P26022 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTX3P26022 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTX3P26022 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTX3P26022 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTX3P26022 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTX3P26022 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTX3P26022 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTX3P26022 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTX3P26022 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTX3P26022 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTX3P26022 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTX3P26022 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTX3P26022 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTX3P26022 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms