Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR1P18146 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR1P18146 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR1P18146 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR1P18146 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR1P18146 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR1P18146 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR1P18146 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR1P18146 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR1P18146 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR1P18146 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR1P18146 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR1P18146 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR1P18146 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR1P18146 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR1P18146 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR1P18146 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR1P18146 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR1P18146 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR1P18146 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR1P18146 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR1P18146 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR1P18146 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR1P18146 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR1P18146 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms