Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms