Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms