Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms