Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DOAP06340 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms