Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EGFRP00533 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EGFRP00533 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EGFRP00533 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EGFRP00533 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EGFRP00533 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EGFRP00533 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EGFRP00533 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EGFRP00533 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EGFRP00533 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EGFRP00533 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EGFRP00533 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EGFRP00533 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EGFRP00533 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EGFRP00533 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EGFRP00533 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EGFRP00533 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EGFRP00533 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EGFRP00533 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EGFRP00533 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EGFRP00533 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EGFRP00533 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EGFRP00533 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EGFRP00533 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EGFRP00533 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EGFRP00533 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFRP00533 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFRP00533 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFRP00533 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFRP00533 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFRP00533 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFRP00533 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFRP00533 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFRP00533 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFRP00533 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFRP00533 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFRP00533 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFRP00533 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFRP00533 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFRP00533 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFRP00533 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFRP00533 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFRP00533 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFRP00533 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFRP00533 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFRP00533 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFRP00533 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFRP00533 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGFRP00533 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGFRP00533 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGFRP00533 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGFRP00533 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGFRP00533 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGFRP00533 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGFRP00533 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGFRP00533 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EGFRP00533 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGFRP00533 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGFRP00533 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGFRP00533 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGFRP00533 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGFRP00533 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGFRP00533 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGFRP00533 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGFRP00533 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGFRP00533 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGFRP00533 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EGFRP00533 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EGFRP00533 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EGFRP00533 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EGFRP00533 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EGFRP00533 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EGFRP00533 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EGFRP00533 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EGFRP00533 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EGFRP00533 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EGFRP00533 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EGFRP00533 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EGFRP00533 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EGFRP00533 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EGFRP00533 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EGFRP00533 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EGFRP00533 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EGFRP00533 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EGFRP00533 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EGFRP00533 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EGFRP00533 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EGFRP00533 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EGFRP00533 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EGFRP00533 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EGFRP00533 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EGFRP00533 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EGFRP00533 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFRP00533 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFRP00533 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFRP00533 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFRP00533 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFRP00533 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFRP00533 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFRP00533 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms