Protein–RNA interactions for Protein: O95405

ZFYVE9, Zinc finger FYVE domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE9O95405 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZFYVE9O95405 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZFYVE9O95405 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZFYVE9O95405 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZFYVE9O95405 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ZFYVE9O95405 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZFYVE9O95405 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZFYVE9O95405 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZFYVE9O95405 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZFYVE9O95405 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZFYVE9O95405 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZFYVE9O95405 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZFYVE9O95405 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
ZFYVE9O95405 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ZFYVE9O95405 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
ZFYVE9O95405 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ZFYVE9O95405 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ZFYVE9O95405 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
ZFYVE9O95405 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
ZFYVE9O95405 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZFYVE9O95405 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZFYVE9O95405 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZFYVE9O95405 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZFYVE9O95405 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZFYVE9O95405 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZFYVE9O95405 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZFYVE9O95405 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms