Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms