Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX3O75364 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX3O75364 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX3O75364 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX3O75364 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX3O75364 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX3O75364 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX3O75364 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX3O75364 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX3O75364 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX3O75364 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX3O75364 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX3O75364 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX3O75364 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX3O75364 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX3O75364 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX3O75364 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX3O75364 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX3O75364 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX3O75364 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX3O75364 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX3O75364 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX3O75364 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX3O75364 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX3O75364 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX3O75364 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX3O75364 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX3O75364 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX3O75364 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX3O75364 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX3O75364 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX3O75364 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX3O75364 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX3O75364 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX3O75364 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX3O75364 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX3O75364 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX3O75364 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX3O75364 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX3O75364 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX3O75364 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX3O75364 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX3O75364 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX3O75364 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX3O75364 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX3O75364 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX3O75364 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX3O75364 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX3O75364 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms