Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3BO75182 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3BO75182 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3BO75182 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3BO75182 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3BO75182 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3BO75182 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3BO75182 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3BO75182 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3BO75182 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3BO75182 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3BO75182 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3BO75182 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3BO75182 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3BO75182 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3BO75182 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3BO75182 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3BO75182 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3BO75182 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3BO75182 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3BO75182 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3BO75182 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3BO75182 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3BO75182 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3BO75182 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3BO75182 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3BO75182 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3BO75182 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3BO75182 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3BO75182 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3BO75182 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIN3BO75182 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms