Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms