Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms