Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms