Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVH48-1M5A8F1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms